海伦市妇幼保健院建于1953年3月，始称海伦县妇幼保健所。1963年由宋庆龄基金会直接拔款建筑了七百四十平方米的妇幼保健楼，于1978年由站改院。1988年11月，保健院新建一座七百二十八平方米病房楼，编制床位50张。新购置了新的医疗设备，人员逐渐增加到—百三十七人，全院分设两办、七科、十二室。妇幼保健科配备技术骨干三十三人，全年在二十九个乡镇，三百六十二个村屯开展妇幼保健工作，充分发挥了妇幼保健的指导中心的作用。是集保健、临床于一体的综合性妇幼保健机构。
多年来通过广大妇幼卫生工作者的辛勤努力，海伦县的妇幼卫生工作初见成效，于1992年9月在我县召开“全省农村妇幼卫生工作现场会。开展了孕产妇和儿童系统保健管理。设立了孕产妇、儿童保健手册。对高危孕妇进行专案管理，实行住院分娩； 0—7岁儿童实行3：2：l体检，对体弱儿进行专案管理。两大系统管理保证了妇女儿童的身心健康，受到上级业务主管部门的认可和广大妇女儿童的好评。
保健院实施《母婴保健法》开展了母乳喂养、生殖健康及婚前保健，出生医学证明管理和新生儿疾病筛查等项工作。